民進黨政府上台以來，綠營不接受「九二共識」，兩岸在沒有政治互信基礎的情況下，大陸國台辦主任與陸委會主委溝通機制等所有官方與半官方交流停擺。其中，《兩岸共同打擊犯罪及司法互助協議》受到政治氛圍影響大，相關協議的執行隨著兩會中斷無法落實，就以電信詐騙案為例，兩岸有沒有互信基礎成為引渡台籍嫌犯回台受審的關鍵。

淡江大學國際事務學院院長王高成指出，在涉及公權力的合作上，雙方要互信友好，對大陸來講，要在兩岸同屬一中之下，才願意與台灣有合作。但民進黨政府不接受「九二共識」，雙方無法保持接觸，這就形同具文了。

舉例而言，2016年4月，馬來西亞政府將一批電信詐欺嫌犯移送大陸偵辦，其中包括數十名台灣人，當時兩岸關係尚屬好的情況下，國民黨文傳會表示，此案經查證確認對岸已知會台灣，並通知台灣派人赴對岸共同偵辦，國民黨認為這個互動模式符合兩岸共同打擊犯罪協議與默契。但是，在民進黨執政上台後，喧騰一時的肯亞案中，44名台籍嫌犯則遭大陸押回審理。

有關於《兩岸共同打擊犯罪及司法互助協議》，台籍大陸律師黃致傑表示，在台灣修法對詐欺案加強刑責後，大陸還是不遣送台籍嫌犯回台，其中重要的原因在於兩會中斷，尤其在蔡英文總統上台以來，幾乎沒有一件案例是往台灣移送，可以說兩岸的政治氛圍會影響台灣人在大陸權益。

黃致傑表示，在該協議裡面，很多內容基本上大陸現在是不執行的，比如台灣家屬可以赴陸探視，政治氛圍會影響到協議內容是否能夠落實。此外，不少台商對訴訟文書的送達也有反映，包含大陸出具的公證書，台灣如果認為有疑慮，海基會送函去函查，但如今國台辦、省台辦都已讀不回。

黃致傑表示，現今兩岸在政治上有所分歧，造成台灣人的權益損失，但是文化角度應是雙方能夠突破的出口，「先文化後政治」，達成雙方都是「一個中華」，即中華民族的基礎上，其他的政治談判，應該是能坐下來好好協商與溝通的。